總目錄:
上冊.
《萬國全圖》序一冊附
《坤與圖說》
《識方外紀》五卷卷首一卷.
《西學凡》一卷附
《景教流行中國碑頌》一卷.
《張彌格爾遺蹟》.
《性學 觕述》八卷
《三山論學紀》一卷
《滌罪正規》附《滌罪正規略》四卷
《悔罪要指》不分卷
《耶穌聖體禱文》不分卷
《萬物真原》一卷
《楊淇園先生超性事蹟》不分卷
《彌撒祭義》附《彌撒祭義略》二卷
《大西西泰利先生行蹟》（亦稱《利瑪竇行寶》）一卷
《幾何要法》四卷
《天主降生引義》二卷

下冊.
《天主降生言行紀略》八卷
《天主降生言行紀像》（又題《天主降生出象經解》）不分卷
《聖夢歌》（亦名《性靈篇》）一卷
《西方答問》二卷
《玫瑰經圖像十五端》不分卷
《天主聖教四字經文》一卷
《口鐸日抄》八卷
《聖體要理》二卷
《五十言餘》（又題《五十言》）一卷
附錄.

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